GfBS Gesellschaft für Biologische Systematik

Details der 7. Jahrestagung - Stuttgart

Die Tagung der GfBS fand vom 14. – 17. September 2004 am Staatlichen Museum für Naturkunde statt.

Programm

Vortragsprogramm (PDF 57KB).

Eine Liste der Poster findet sich hier. Der Abstract-Band der Tagung kann hier heruntergeladen werden: Abstracts (PDF 941KB).

Dienstag, der 14. September


    15:00 Uhr Vorstandstreffen
    17:00 Uhr Öffnung des Tagungsbüros im Schloss Rosenstein, bitte nutzen diese Möglichkeit und registrieren sich schon am Dienstag!
    19:00 Uhr Abends "Ice-breaker" Abend im Schloss Rosenstein

Mittwoch, der 15. September


    8:00 Uhr Öffnung des Tagungsbüros im Museum am Löwentor
    9:00 Uhr Begrüßung durch Frau Dr. habil. Johanna Eder (Direktorin des SMNS) und Prof. Dr. Wolfgang Wägele (Präsident der GfBS) im Vortragssaal
    anschließend Begrüßung durch den Ministerialdirigenten Hans Georg Koch im Vortragssaal, in Vetretung des Ministers für Wissenschaft, Forschung und Kunst Prof. Dr. Peter Frankenberg.
   

1. Themenblock: Eichung Molekularer Uhren

9:40 Uhr Hauptvortrag im Vortragssaal von Prof. Dr. Susanne Renner (Botanische Staatssammlung, München): "Die Probleme und Möglichkeiten simultaner, multipler Eichungen von molekularen Uhren"
    Kurzvorträge
    11:00 Uhr bis 11:20 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge
    12:40 Uhr bis 14:10 Uhr Mittagspause mit dem Treffen der Jungen Systematiker
    14:10 Uhr Hauptvortrag des 2. Themenblocks im Vortragssaal
    danach Kurzvorträge im Schulungsraum
    15:50 Uhr bis 16:10 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge bis 16:50 Uhr
    2. Themenblock: Änderungen der Biodiversität in der Zeit
    14:10 Uhr Hauptvortrag im Vortragssaal von Prof. Hans Kerp (Universität Münster): "Der Rhynie Chert, eines der ältesten und meist vollständig erhaltenen Ökosysteme"

Kurzvorträge

    15:50 Uhr bis 16:10 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge bis 17:10 Uhr
    Postervorstellung Mittwoch 17:10 Uhr bis 17:40 Uhr (keine Führung, sondern direkte Einzeldiskussionen)
    18:00 Uhr Mitgliederversammlung im Vortragssaal
    19:30 Uhr Im Vortragssaal: Öffentliche und 1. Verleihung des Bernhard-Rensch-Preises der Gesellschaft mit Vorrede und Einführung durch zwei kurze

Referate

    1) Th. Junker (Tübingen): "Bernhard Rensch und die Entstehung der Synthetischen Evolutionstheorie".
    2) H. Rahmann, M. Berger und G. Dücker (Stuttgart, Münster): "Bernhard Rensch als Universalist".
    Anschließend folgt der Vortrag des Preisträgers, Dr. Martin Fanenbruck, Bochum.

Donnerstag, der 16. September

 

    3. Themenblock: Evolution der Artenvielfalt in Insel- und Refugialhabitaten

    9:00 Uhr Hauptvortrag im Vortragssaal Dr. Helmut Schmalfuß (SMNS) & Dr. Thomas Raus (Botanischer Garten und Botanisches Museum, Berlin-Dahlem): "Insuläre Biodiversität in der Ägäis"
    Kurzvorträge
    10:40 Uhr bis 11:00 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge
    12:40 Uhr bis 14:10 Uhr Mittagspause
    Kurzvorträge
    15:30 Uhr bis 15:50 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge bis 17:30 Uhr

    4. Themenblock: Freie Themen

 

    kein Hauptvortrag, sondern Kurzvorträge im Schulungsraum ab 9:40 Uhr nach dem Hauptvortrag des 3. Themenblocks (s.dort)
    Kurzvorträge
    10:40 Uhr bis 11:00 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge
    12:40 Uhr bis 14:10 Uhr Mittagspause
    Kurzvorträge
    15:30 Uhr bis 15:50 Uhr Kaffeepause
    Kurzvorträge bis 17:30 Uhr
    Postervorstellung 17:30 Uhr bis 18:15 Uhr (keine Führung, sondern direkte Einzeldiskussionen)
    Abgabe der Posterstimmzettel bis 18:15 Uhr
    18:30 Uhr Verleihung der Posterpreise im Vortragssaal
    19:00 Uhr Im Vortragssaal: Öffentliche Verleihung der Ehrenmitgliedschaft an Prof. Friedrich Ehrendorfer und anschließend dort: Öffentlicher Vortrag von Prof. Friedrich Ehrendorfer (Universität Wien): "Hybridisierung erhöht die Artenvielfalt in der Evolution", danach gibt es ein Buffet.

Freitag, der 17. September


    der Kuratorentag findet im Vortragssaal statt.
    Führungen durch das Museum (hinter die Kulissen) im Schloss Rosenstein und am Löwentor. Auf der Tagung werden Listen mit den angebotenen Führungen ausgelegt, die am Vormittag stattfinden werden.
    Führungen durch die Wilhelma (Stuttgarter Zoo und Botanischer Garten) finden von 14:00-15:30 Uhr statt. Treffpunkt ist der "Eingang Rosensteinpark", auch als "Oberer Eingang" bekannt, der Wilhelma, der uns nächstgelegene Eingang im Rosensteinpark.
    Workshop und Demonstration von Computersoftware zu Phylogenetischen Rekonstruktionen: der Workshop findet im Schulungsraum statt, geplant sind (siehe am unteren Ende der Seite)
    9:00 Uhr bis 12:00 Uhr: Baumkonstruktion von Dr. Heiko Schmidt (NIC, FZ Jülich) und
    13:00 Uhr bis 16:00 Uhr: Konstruktion von "Supertrees" aus heterogenen Datensätzen von Dr. Olaf Bininda-Emonds (TU München).

Reisekosten


Ein Reisekostenzuschuss kann in beschränktem Umfang für eine begrentze Zahl von Studenten auf Antrag bei Prof. Dr. Wägele (Fakultät für Biologie, Ruhr-Universität Bochum, Universitätsstr. 150, D-44801 Bochum, Tel.: 0234-32-24563, Fax: 0234-32-14114, email: Wolfgang.Waegele@rub.de ) gewährt werden.

Workshop und Demonstration von Computersoftware zu Phylogenetischen Rekonstruktionen

    9:00 Uhr bis 12:00 Uhr: Baumkonstruktion von Dr. Heiko Schmidt (NIC, FZ Jülich) und

    13:00 Uhr bis 16:00 Uhr: Konstruktion von "Supertrees" aus heterogenen Datensätzen von Dr. Olaf Bininda-Emonds (TU München).

Baumkonstruktion von Dr. Heiko Schmidt (NIC, FZ Jülich)

9:00 Uhr bis 12 Uhr

The outline of the morning workshop is as follows:
1) Introductory lecture on tree-building and tree optimization methods. A number of problems will be described that might occur during phylogenetic analysis and how they are tried to be solved by different programs.
2) In a second part the program SplitsTree and the underlying theory will be explained. Additionally common mistakes interpreting phylogenetic networks will be discussed.
3a) Practical exercise performing quality assessment on different provided datasets using the TREE-PUZZLE software.
3b) Trees will be reconstructed and analyzed using the TREE-PUZZLE software (and possibly other methods from the PHYLIP package).
4) Exercise: Phylogenetic networks will be constructed using SplitsTree from provided datasets and using TREE-PUZZLE.
Results from 3) and 4) will be briefly discussed. The attendants are free to additionally use own datasets, advice will be given as far as time allows.
Required Software:1) TREE-PUZZLE There will be a beta release for the workshop at <http://www.bi.uni-duesseldorf.de/~hschmidt/gfbs> with features to interact with SplitsTree. (This will be available end of the week or after the weekend.)
2) SplitsTree (<http://www-ab.informatik.uni-tuebingen.de/software/jsplits/>), please download the version under LATEST BUILD (<http://www-ab.informatik.uni-tuebingen.de/software/latest/>). Although showing the same version number, the LATEST BUILD has a lot of bugs fixed!!!3) Additional phylogenetic software, e.g., PHYLIP (<http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html>)4) Any tree viewer, like TreeView (<http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html>)5) A PostScript graphics viewer: GhostScript/GhostView recommended (<http://www.ghostscript.com/>). Download the version for your operating system at <http://www.cs.wisc.edu/~ghost/doc/AFPL/get814.htm>(Windows gs814w32.exe AND gsv46w32.exe; Linux: should hopefully installed by default; MacOS: get the version from there, but there might already a PS-viewer installed). If your OS can display the file <http://www.bi.uni-duesseldorf.de/~hschmidt/gfbs/globin.a.eps> you don't need another PostScript viewer.Optional:1) An alignment editor (e.g. seaview: <http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview.html> or QAlign: <http://www.ridom.de/qalign/> or whatever you are used to.)2) Data sets / phylogenetic trees from the your study group.Konstruktion von "Supertrees" aus heterogenen Datensätzen von Dr. Olaf Bininda-Emonds (TU München)13 Uhr bis 16 UhrThe outline for the workshop is as follows:

1) Introductory lecture (~ 30 minutes).
A brief introduction to supertree construction: what is it, what can be done with it, and why one might want to use it. The contrast between combining trees (supertrees) and character data (supermatrices / total evidence) will be covered in particular.

2) Practical exercise into "traditional" supertree construction.
Workshop participants will construct a supertree for the 19 extant species of the mammalian family of true seals (Phocidae) using source trees obtained from the literature (provided). This exercise will introduce the concept of "matrix representation", which underlies the most popular supertree method. It will also highlight the (taxonomic) problems that are encountered in combining any data, plus some problems that are specific to supertree construction.

The BUILD algorithm, which underlies a separate family of supertree techniques, will also be introduced using a simple example to be worked out by hand.

The exercise will be followed by brief discussion.

3) Practical exercise comparing supertree and supermatrix techniques.
Participants will compare the two methods using a heterogeneous supermatrix, largely of the mammalian family of even-toed ungulates and whales (Cetartiodactyla) of Gatesy et al. (2001. Syst. Biol. 51(4): 652-663.). A supertree will be constructed from the trees derived from the partitions in the supermatrix (provided) using any of a number of techniques and compared to the tree obtained from the analysis of the entire matrix published in the paper.

The exercise will be followed by brief discussion.

4) Introduction to TreeBASE and/or working with datasets from the participant's study group (optional and time permitting).
A brief introduction will be given to TreeBASE (http://www.treebase.org/treebase/index.html), an online repository of phylogenetic trees and, thus, a source of data for supertree analyses. (Note that only a limited number of connections to the internet will be available, such that participants might have to work in small groups.) Participants are also encouraged to bring along their own data sets for analysis or for advice on how best to analyze it.
Software list:Required:

1) Any parsimony program (e.g., PAUP*, TNT, WinClada, dnapars, ...)

2) Any data editor (e.g., TNT, WinClada, MacClade (note: Mac only)). Note that WordPad and Microsoft Excel can also be used.

3) Any tree editor program, such as:
TreeView: taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html (note: NOT TreeView X)
Component: taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/cpw.html
Mesquite: mesquiteproject.org/mesquite/mesquite.html
SuperTree: www.tcd.ie/Botany/NS/SuperTree.html
MacClade (note: Mac only)

4) Any or all of the following supertree programs:
CLANN: bioinf.may.ie/software/clann/ (note: often difficult to connect to website)
Rainbow: genome.cs.iastate.edu/CBL/download/ (note: requires PAUP* v4.0b10)
SuperTree: www.tcd.ie/Botany/NS/SuperTree.html (note: can also be used as a tree editor)
RadCon: web.onetel.com/~joethorley/radcon/radcon.html (note: Mac only)

Optional:

1) Web browser

2) Supermatrix data file from Gatesy et al. (2001. Syst. Biol. 51(4): 652-663.): hydrodictyon.eeb.uconn.edu/systbiol/issues/51_4/vol51_4.html. The paper itself might also be worth reading.

3) Data sets / phylogenetic trees of the participant's study group.